卡方检验确定背景序列模型Markov chain的阶数

合理建模非编码序列对正确识别DNA序列中的调控元件非常重要.基于卡方统计检验,给出了选用Markov chain模型来模拟序列背景分布的原因及如何确定Markov chain阶数的方法.卡方测试分析模拟数据发现它能有效地确定模型阶数.选择分析啤酒酵母中10类基因的上游序列集发现:所有序列集至少具有一阶以上的上下文相关性,除1组基因外,其余9组数据集具有二阶或三阶的上下文相关性.这说明用高阶Markov chain来建模背景序列比单碱基模型(零阶)更合理.
β-防御素是机体的内源性抗菌肽.酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)甘露聚糖能够诱导绵羊(Ovis aries)瘤胃上皮细胞(ruminal epithelial cells,RECs)β-防御素-1 (sheepβ-defensin-1,SBD-1)的表达,但是诱导机制尚不明确,限制了甘露聚糖制剂的开发利用.为了探讨丝裂原活化蛋白激酶(mitogenactivated protein kinase,MAPK)信号传导通路(p38,ERK1/2,JNK)和核因子κB (nuclear factor κB,NF-κB)通路是否参与甘露聚糖诱导绵羊RECs SBD-1的表达,首先利用qPCR和Western blot方法检测甘露聚糖对p38、ERK1/2、JNK和NF-κB表达的影响;然后用甘露聚糖分别刺激RECs 5、15、30、45和60 min后,通过Western blot检测p38、ERK 1/2、JNK、IκB和p65的磷酸化水平;最后采用qPCR和ELISA方法检测p38、ERK1/2、JNK和NF-κB的特异性抑制剂对甘露聚糖诱导SBD-1表达的影响.结果 显示,甘露聚糖刺激使RECs中p38、ERK1/2、JNK和NF-KB的mRNA水平以及p38、JNK、ERK1/2、IκB和p65的磷酸化水平均显著提高(P＜0.01);同时,甘露聚糖刺激RECs不同时间可以使p38、ERK1/2、JNK、IκB和p65发生磷酸化;此外,p38、ERK1/2、JNK和NF-κβ的抑制剂均能极显著降低甘露聚糖诱导SBD-1的表达(P＜0.01),且p38抑制剂的抑制效果最明显.上述结果提示,酿酒酵母甘露聚糖诱导绵羊RECs SBD-1表达的过程可能由p38、ERK1/2、JNK和NF-κB信号通路共同调节,并且p38信号通路可能发挥更主要的作用.该研究探讨了甘露聚糖诱导防御素表达的机理,为解释甘露聚糖促免疫功能提供了新线索,也为更好地开发和利用甘露聚糖制剂提供了参考依据.
为了利用转基因技术在酿酒酵母Saccharomyces cerevisiae中生产二十二碳六烯酸(DHA,22∶6A4,7,10,13,16,19n-3),构建了同时含C20-△5脂肪酸碳链延长酶(TFD5)和C22-△4脂肪酸碳链脱饱和酶(FAD4)基因的共表达质粒pYTFD5-FAD4.该质粒是通过基因重组的方法,使脂肪酸碳链延长酶与脱饱和酶基因置于各自启动子和终止子下获得的.共表达质粒pYTFD5-FAD4转化酿酒酵母所得到基因工程菌,在添加终质量分数为2%的半乳糖,终体积分数为1%的NP-40和0.3 mmol/L的底物二十碳五烯酸(EPA,20∶5△5,8,11,14,17n-3)下进行诱导,可直接转化二十碳五烯酸(EPA,20 ∶ 5△5,8,11,14,17n-3)生成二十二碳五烯酸(DPA,22 ∶ 5△4,7,10,13,16n-3)和二十二碳六烯酸(DHA,22 ∶ 6△4,7,10,13,16,19n-3).
采用生物接触氧化工艺为主体处理啤酒废水,结合水解酸化预处理和混凝气浮后处理,结果表明,此工艺能够有效的处理啤酒废水,可达到国家<污水综合排放标准>(GB 8978-1996)中的一级排放要求,是一条经济合理的技术路线.
本发明涉及一种新型葡萄白酒及其酿制方法，它是将葡萄破碎分离后将果汁和皮渣分别加入不同特性的活性干酵母，酿造出具有水果酒特性和白酒特性的两种原酒，再经调配得到兼具葡萄酒特性和白酒特性的新型水果白酒，既具有水果酒的果香，又具有白酒的醇厚感。
用6.9%大骠马乳油750 g/hm2和40%燕麦畏乳油2 250 g/hm2防除啤酒大麦田野燕麦的试验结果表明,两种药剂均有良好的除草效果,防效分别为91.6%、87.5%.以6.9%大骡马乳油750 g/hm2的除草效果较优,且省工省时,安全经济.